A impermeabilização das lagoas consistiu em obras para desvio do fluxo normal das águas do complexo para isolamento das áreas a serem impermeabilizadas e posteriormente dragagem das águas para esvaziamento das lagoas. Foram escavados mais de 240 mil m³ entre materiais contaminados e solo para conformação do fundo e taludes da lagoa, que totalizaram 74 mil m². Na sequencia foram compactadas camadas de liners, aplicação de 90 mil m² de geomembrana em PEAD para impermeabilização e compactação de camadas de proteção. Em algumas áreas foram aplicadas geocéculas revestidas por concreto, permitindo a dragagem de material decantado no fundo da lagoa. Serviços complementares de drenagens, poços de monitoramento, projeto executivo detalhado, montagens elétricas e de bombas foram executados pela Nóbrega Pimenta.